2026-05-16中标｜合同公告江西省|南昌市项目编号2611401000003809258招标状态中标｜合同公告发布时间2024-09-02 14:42:46标书获取截止时间投标截止时间开标时间招标单位江西省水产科学研究所(江西省鄱阳湖渔业研究中心、江西省渔业资源生态环境监测中心)预算金额中标单位上海美吉生物医药科技有限公司中标金额1.30万元代理单位相关产品微生物多样性测序联系方式徐先栋：15270927610正文内容 一、采购人名称： 江西省水产科学研究所 二、供应商名称： 上海美吉生物医药科技有限公司 三、采购项目名称： 江西省水产科学研究所服务工程项目 四、采购项目编号： 2611401000003809258 五、合同编号： 2024M0902369900000020 六、合同内容： 序号 标项名称 规格型号 单位 数量 单价(元) 总价(元) 1 微生物多样性测序 件 1.00 13000 13000 服务要求或标的基本概况： 七、其它事项： 无 八、联系方式 1、 采购人名称： 江西省水产科学研究所 联系人： 鱼病室 联系电话： 1786392**** 传真： 地址： 南昌市富大有路1099号 2、供应商名称： 上海美吉生物医药科技有限公司 地址： 上海上海市浦东新区康新公路3399弄3号楼 附件信息： 环境微生物群落多样性测序及交互式分析项目合作协议书.pdf 关于宏基因组测序的服务工程合同(2024M0902369900000020).pdf 力上海美吉生物医药科技有限公司美吉生物ShanghaiMajorbioBio-pharmTechnologyCo.,LtdMajorbio浙项目合作协议书测11环境微生物群落多样性测序及交互式分析合同编号：YF20240817043.甲方:江西省水产科学研究所地址：江西省南昌市青山湖区富大有路1099号课题组名称:徐先栋项目联系人*:徐先栋电话:15270927610项目联系人邮箱:xuxd2009@163.com美吉生物云账号*:xuxd2009@163.com乙方*:上海美吉生物医药科技有限公司地址:上海市浦东新区国际医学园区康新公路3399弄3号楼联系人:帅德勇电话:13732938740有效期限：2024年08月01日至2025年08月01日签订地点：上海在本合同签订之前，请仔细阅读以下内容非另有约定，本合同使用的下列除术语应具有如下界定的含义：1.“合同”或“本合同”：指本合同正文和其附件，共同构成合同整体并相互补充；2.“交付成果”：指乙方根据本合同规定交付的服务成果，包括信息采集数据或分析结果等；3.“技术障碍”：指在乙方现有条件下无法克服的技术问题，包括但不限于因合同约定的技术方法、技术路线、履行合同所使用的设备、仪器、软件等本身的缺陷或局限性、生物特性、生物个体差异性等导致的无法克服的技术问题。依据《中华人民共和国民法典》的规定，通过友好协商，本着诚信与互利的原则，双方就环境微生物群落多样性测序及交互式分析服务事宜达成协作如下：一、合作内容1.甲方美吉生物科服网账号（原云平台账号）：xuxd2009@163.com。美吉生物科服网是乙方为甲方提供项目服务的一站式综合信息平台，包括VIP客户中心（项目追踪平台）、组学数据分析云平台（交互分析平台）、云课堂和文库（产品学习资料平台）等模块。甲方可通过VIP客户中心追踪项目进度并反馈项目相关信息。甲方90在购买了云平台服务的基础上，可以进行自主分析、数据挖掘，并获取个性化分析结果。通过云课堂和文库深度学习，提升数据挖掘能力。2.甲方提供合格的实验样本信息1）样本来源：水体，沉积物；2）样本形式：环境样品；3）样本数量：80；4）提供实验样本的相关详细资料信息（请注意送样样本命名规范，样本名称必须以英文字母开头，命名支持1英文字母、数字、下划线，不可使用空格、中划线或NA、NULL等字符）；5）乙方对甲方的实验样本进行检测，确认样本符合要求后开展实验（送样要求详见附件一）3.乙方完成的实验包括（详细信息请认真详细填写）：1）完成80个样本DNA提取；2）完成0个cDNA的合成（仅限抽提类型为RNA的样本填写）；3）完成80个样本的质检；4）设计80个样本PCR扩增引物以及tag序列，引物选择如下：引物名称引物类型F端序列R端序列长度合成数量合成价格338F806R细菌16SrRNAACTCCTACGGGAGGCAGCAGGGACTACHVGGGTWTCTAAT46800.备注：请确保所使用引物扩增产物长度在300-500bp以内；5）若有扩增条件要求，甲方提供PCR条件如下：6）完成80个制备PCR扩增和纯化；7）使用Picogreen染料荧光计对80个PCR产物进行定量并均一化混匀；8）完成80个PCR产物的I1lumina测序（需保证PCR产物大小在300-500bp之间）引物名称样本个数最低单样本数据量单位平均单样本数据量约单位测序方式1338F806R18040000cleanreads50000cleanreadsPE3004.项目完成后最终原始数据的发送，根据数据量的大小选择不同的发送方式（1）数据传输方式存储量发送方式费用数据传输形式备注不限网盘传输0-√不限公有云极速释放1元/G根据硬盘大小硬盘传输0（2）硬盘购买存储量发送方式费用个数数据传输形式备注500Gb移动硬盘+快递到付350元/个1Tb移动硬盘+快递到付500元/个2Tb移动硬盘+快递到付800元/个5.样品数据管理协议1）原始样本和核酸保存周期：已完成实验的项目在分析结果发送给甲方后：原始样本和核酸保存3个月；2）交互分析使用周期：自云平台结果交付之日起，甲方可以使用云平台进行数据挖掘12个月；3）分析数据保存周期：自结果交付之日起，乙方将为甲方免费保存结果文件12个月；4）原始数据保存周期：乙方承诺在最终数据提供后，乙方将为甲方免费保存原始数据3个月。-...5）剩余样品处理方式：项目样本标准分析结果交付，原始样本和核酸保存周期到期后，乙方将根据样品处理签订方式处理样品返样：销毁：返样方式：销毁；返样次数：0说明：若选择返样注明返样方式：①公司寄付（需收取干冰和快递费）②快递到付（需收取干冰费，快递费客户自付）需要干冰和寄送快递并支付相应费用。6.补充条款无7.交互式生物信息云分析：乙方按照合同约定的分析方式和线上交互报告-完整分析报告交付方式为甲方提供附件四中的美吉生物科服网（http://www.majorbio.com/）交互式微生物多样性云分析服务。甲方在合同有效期内享有本合同数据的交互式云分析服务，并可在线查看、下载、打印结果报告。8.在合同期限内，乙方承诺配合甲方文章撰写时针对合同约定分析内容的修改和解答工作。甲方在文章发表时，请在方法或者致谢部分提及美吉生物科服网云平台；可参考示例：ThedatawereanalyzedonthefreeonlineplatformofMajorbio.CloudPlatform（www.majorbio.com）或者XXX，XXXandXXXanalysiswereperformedusingthefreeonlineplatformofMajorbioCloudPlatform（www.majorbio.com）二、服务周期1.乙方在收到甲方样本，并与相关纸质版和电子版信息单核对无误后开始进行样本制备。待甲方首付款到位和确认正式实验后，开始核算项目服务周期。2.样本制备：5-6个工作日完成DNA抽提及其质检工作：5-10个工作日完成预实验+正式试验+胶回收+定量，并将最终PCR实验结果发送给甲方。乙方将对所有扩增结果为A的样品进行测序，测序结果以达到合同要求为准；扩增结果为B的样品可以做测序的尝试，存在补测数据的风险；扩增结果为C的样品无法满足后续测序要求，建议甲方取消或者重新送样。3.待甲方确认及收到甲方预付款后，开始正式实验。I1luminaPE300测序7-10个工作日，PE250周期较长10-15个工作日完成测序工作（时间视具体样本数量及特点而定）。合同周期从最后一次送样算起。4.交互式生物信息云分析：乙方在测序工作完成后3-5个工作日内将美吉生物云账号和本合同交互式云分析项目发送甲方（时间视具体样本测序量而定）。备注：若测序和数据处理中遇到技术障碍，乙方应与甲方及时沟通，双方沟通及处理障碍的所用时间从周期中扣除（五一、十一、春节等国家法定节假日不计入项目周期）。三、结果验收1.结果内容：乙方完成合同中第一条（合作内容）中约定的内容。..有2.结果发送：若为交互式云分析项目，则结果发送方式为：乙方在完成本合同约定的工作后，以电子邮件方式发送云平台账号和交式云分析结果给甲方；若非交互式云分析项目，则结果发送方式为：乙方在完成本合同约定的工作后，以电子邮件方式发送结题报告给甲方，说明项目完成情况。3.交互式云分析数据交付：自云平台结果交付之日起，甲方在合同中第一条（合作内容）约定的交互分析使用周期内可以使用云平台进行数据挖掘；若甲方未在届满期前向乙方书面提出申请继续使用云平台进行数据分析，乙方将在届满期后不再提供云平台项目的交互功能；如果甲方在届满期前书面提出继续使用云平台进行数据分析，则需补充签订协议并根据实际使用时间进行计费。4.非交互式云分析数据交付：自结果交付之日起，乙方将依据合同中第一条（合作内容）约定的分析数据存储周期为甲方免费保存结果文件，若甲方未在届满期前向乙方书面提出申请继续保存结果文件，乙方将在届满期后自动删除；如果甲方在届满期前书面提出继续保存结果文件，则需补充签订协议根据实际保存时间进行计费。5.咨询服务：成果交付12个月内，乙方有义务向甲方提供免费的项目咨询服务，咨询服务标准及方式由乙方决定，超过此期限，乙方有权根据实际技术咨询情况另行计费。6.最终原始数据的发送：乙方完成合同中第一条（合作内容）中约定的内容。7.原始数据保存：为方便甲方测序或质谱数据的使用，乙方承诺在最终数据提供后，将依据合同中第一条（合作内容）约定的原始数据存储周期继续为甲方保存数据。若甲方未在届满期前10日书面提出继续保存数据，乙方将在届满期后立即删除，不再提供数据找回服务。如若甲方在届满期前10日书面提出继续保存数据，则需补充签订协议并根据实际存储数据量与存储时间进行计费。四、双方责任1.甲方责任：（1）甲方须按照合同约定向乙方提供合格的足量样本（样本要求见附件一）及完成项目所需的样本信息（如分组方案）。甲方在提供样本的同时须准确填写纸质版和电子版的《样本信息表》，并将电子版的《样本信息表》发送给乙方，在表中需备注重要说明等情况（填表时应尽量避免错误、遗漏以及容易引起歧义的词汇及描述方法）。因不规范送样造成的项目问题均由甲方承担。不规范送样包括但不限于以下情况：①未按照送样要求处理样本并包装；②未及时提供准确的样本信息单；③未及时告知乙方送样信息（2）甲方提供的样本不符合乙方要求（包括但不限于样本制备不符合本合同要求、达不到信息采集标准、样本污染、样本损坏等）导致合同终止时，甲方按照乙方实际工作量以市场价格支付全部费用并赔偿乙方的其他损失。若送样类型及数量与合同描述不符，导致产生额外提取或其他费用，甲方须签订补充协议，方可继续启动项目。（3）甲方须承诺，提供给乙方的样本在采集、运输、保存等过程中均符合相关国家法律法规及伦理规范：特别是人类血液及其它人源样本及附带个人信息的采集使用已获得被采集者的知情同意。甲方若以本合同项下产生或乙方向甲方交付的成果为基础而进行后续利用或开发，该等行为或活动均与乙方无关。..（4）甲方需确保所提供的样本无致病性。合同生效时默认甲方对样本的安全性做出承诺。若因样本具有致病性从而威胁到公共安全，甲方需承担相应的一切责任。（5）甲方需按时提供合同中约定提交的技术资料。如因甲方未能及时提供技术资料而导致实验延误，乙方不承担责任。（6）如因非乙方原因导致合同执行中止时，甲方应按照乙方实际执行的工作量支付费用。2.乙方责任：（1）乙方需保证合同在约定期限内完成。如因乙方过错导致项目延迟，乙方应及时与甲方沟通，说明情况并商定合同完成时间。检测分析工作启动后，若因乙方问题导致样本损毁，乙方可以为甲方继续重复试验，不另计技术服务费用；若甲方不能继续提供样本，则甲方可以将已付款项转入下一次服务。乙方不承担由此导致的其他责任。（2）乙方需保证提交的结果与合同约定一致。如因乙方提供的结果不符合双方约定，乙方应重新提供。且乙方应保证对其交付给甲方的研究成果进行充分、详见的解释，乙方只保证实验及数据分析的真实性和可靠性，不保证符合甲方生物学意义的要求。（3）如果由于机器、试剂等不可预料的原因导致测序结果不合格，乙方应及时通知甲方并提供相应证据，同时负责重新测序。（4）乙方的检测结果是根据甲方提供的材料及样本做出，对甲方提供的材料及样本来源不承担任何审查义务及法律责任，如因甲方提供的材料及样本等导致乙方面对任何索赔、指控时，甲方应承担相应法律责任，并使乙方免于承担任何责任。（5）乙方将提供一定的样本免费存储服务，具体如下：①未开展实验项目的所有样本类型，保存时间为1个月，甲方送样前应及时与乙方沟通，如样本到公司后一个月内未开展实验，乙方有权对样本进行销毁，因此项原因产生的费用，由甲方承担，乙方不承担任何责任。②检测合格待建库的核酸、PCR产物，保存时间为3个月，甲方应在乙方发送样本质检报告或PCR实验报告后3个月内反馈是否进行正式实验，如逾期反馈开展试验，由甲方承担由此产生的项目风险：如逾期未反馈，乙方有权对样本进行销毁。③对于检测不合格的样本，甲方应在乙方将样本检测报告发出后7天内与乙方联系，并邮件确认该不合格样本的处理方式，如甲方逾期未与乙方联系，该不合格逾期样本会在样本检测报告发出后的7天后进行销毁。④已完成实验的项目在分析结果发送给甲方后：甲方将依据合同中第一条（合作内容）约定的原始样本和核酸保存周期进行样品保存；甲方提供的用于做多样性项目的PCR产物保存时间为上机后1个月；甲方提供的用于做多样性项目的PCR产物上机后，乙方为甲方提供该PCR产物的免费存储服务1个月。（6）对于超出免费存放期限的样本，乙方提供有偿存续服务，甲方可在样本免费存放届满期前10个工作日补充签订协议，收费标准500/样本/年。乙方将严格按照本实验室管理规范进行样本保存管理，但不承诺样本质量保存不变。..（7）如乙方在履行本合同中需要使用第三方数据库，则由甲方委托乙方下载，并由甲方负责承担所有知识产权相关的法律责任。为履行本协议项下义务之目的，乙方可将其在本合同项下的权利义务全部或部分转让给乙方的关联方或者第三方。五、付款及价格本合同实付金额为人民币13000.00元整（壹万叁仟圆），（不含税金额：：12264.15元，税额：735.85元)。甲方应在实验开展之前将合同实付金额的100%即人民币13000.00元整（壹万叁仟圆）汇入乙方账户。实验完成后，乙方将合同约定分析结果发送给甲方。乙方确认收到全款5个工作日内把原始数据发送给甲方。备注：①每个样本默认提供一次抽提，如果抽提失败，可以免费重新抽提一次。如果需要继续抽提，则按照人民币30元整（叁拾圆整）/样本/次进行收费。②合同默认对每个样本每对引物提供一次PCR扩增，如果扩增失败，可以免费进行第二次扩增，根据合同收取一次PCR扩增费用。从第三次扩增开始起，则按照人民币20元整（贰拾圆整）/样本/次进行收费。③若PCR成功而不进行后续实验，取消实验样本个数需按照40元整（肆拾圆整）/样本进行收费。④双方约定依据送样量约定合作价格，结算规则如下：实际送样个数≤合同总量的40%，结算样本单价在合同约定单价的基础上上浮15%；合同总量的40%基础上上浮10%；合同总量的80%若为交互式生物信息云分析项目请自行在美吉生物科服网（www.majorbio.com）查看数据分析报告。如果返样，收费标准如下：干冰费用200元/次；快递寄送费用200元/次，或者选择到付。所有款项甲方应采用转账方式支付。开户单位：上海美吉生物医药科技有限公司开户银行：上海浦东发展银行股份有限公司张江科技支行开户帐号：97160154740003720六、保密责任1.甲乙双方对该项目原始资料、技术路线、实验报告、服务价格等有保密义务。未经甲方书面、来函或邮件同意，乙方不得将本项目相关的资料、样本、实验数据泄漏给第三方；未经乙方书面、去函或邮件同意，甲方不得将本项目技术路线等涉及乙方机密的资料泄漏给第三方。2.保密期限：自合同生效日起3年。.3.泄密责任：一切责任由泄密方承担。七、解决合同纠纷的方式本合同的生效、解释和履行适用中华人民共和国法律。在履行本合同的过程中发生争议，双方当事人和解或调解不成，双方约定向合同履行地人民法院起诉。八、合同解除1.合同解除，是指依法提前终止合同关系。甲乙双方可以协商解除合同。2.双方确定，出现下列情形，致使本合同的履行成为不必要或不可能的，可以解除本合同1）发生不可抗力或技术障碍；2）因对方违约使合同不能继续履行或没有必要继续履行3.甲方提供的工作条件、样本等材料不符合乙方要求，经乙方提示后仍不能提供的乙方有权单方解除合同。除本合同另有约定外，合同解除后，甲方需按照乙方实际完成的工作量支付费用。九、合同生效本协议一式两份，由甲方、乙方各持一份，均具有同等效力。自双方授权代表签字并盖章后生效。本合同取代此前可能存在的双方之间的有关本次服务的任何书面或口头的约定，自双方签字盖章之日起生效，经签署本合同，双方确认将仅以本合同的明确约定为调整双方合同关系的陈述、承诺或保证。十、补充约定1.双方确定，在本合同有效期内，甲方指定徐先栋为甲方项目联系人，电话号码：15270927610；乙方指定帅德勇为乙方项目联系人，电话号码：13732938740。项目联系人承担以下责任：1）依据本合同约定内容推动双方正常履行合同；2）对该合同各条款相关事宜及时进行沟通；3）一方变更项目联系人的，应当及时以书面形式通知另一方。未及时通知并影响本合同履行或造成损失的，应承担相应的责任。2.合同结算依据合作服务内容特性，甲乙双方项目合作存在分批以子订单执行的情况，当合同分为子订单分批执行时，乙方完成子订单对应工作量，发送相关信息给甲方确认，甲方应按该子订单工作量占合同总订单量之比承担相应的服务费。3.未尽事宜，双方可协商解决并予以补充。甲方（盖章）：江西省水产科学研究所乙方（盖章）：上海美吉生物医药科技有限公司+A甲方代表：乙方代表：日期：日期：附件三I1lumina平台免收引物合成及预实验费用引物信息表一：下表引物测序数据量为平均5万条cleanreads，单样本数据量最低不低于平均数据量的80%。测序类型引物名称引物序列长度参考文献备注适用样品/测序策略细菌16SrRNA27F5-AGAGTTTGATCCTGGCTCAG-3311bp[1]V1-V2区细菌16SrRNA338R5-TGCTGCCTCCCGTAGGAGT-3311bp[1]V1-V2区PE250/PE300细菌16SrRNA27F5-AGAGTTTGATCCTGGCTCAG-3506bp[2]V1-V3区细菌16SrRNA533R5-TTACCGCGGCTGCTGGCAC-3506bp[2]V1-V3区PE300细菌16SrRNA515F5-GTGCCAGCMGCCGCGG-3392bp[3]V4-V5区，含宿主样本不推荐细菌16SrRNA907R5-CCGTCAATTCMTTTRAGTTT-3392bp[3]V4-V5区，含宿主样本不推荐PE250/PE300细菌16SrRNA338F5-ACTCCTACGGGAGGCAGCAG-3468bp[4]V3-V4区细菌16SrRNA806R5-GGACTACHVGGGTWTCTAAT-3468bp[4]V3-V4区PE250/PE300细菌16SrRNA34F5-CCTAYGGGRBGCASCAG-3465bp[5]细菌16SrRNA806R5-GGACTACNNGGGTATCTAAT-3465bp[5]PE250/PE300细菌16SrRNA515F5-GTGYCAGCMGCCGCGGTAA-3~420bp[6]V4-v5区细菌16SrRNA926R5-CCGYCAATTYMTTTRAGTTT-3~420bp[6]V4-v5区PE250/PE300细菌16SrRNA341F5-CCTACGGGNGGCWGCAG-3460bp[7]细菌16SrRNA785R5-GACTACHVGGGTATCTAATCC-3460bp[7]PE250/PE300细菌16SrRNABa9F5-GAGTTTGATCMTGGCTCAG-3506bp[8]V1-V3多应用于瘤胃液细菌16SrRNABa515RmodlR5-CCGCGGCKGCTGGCAC-3506bp[8]V1-V3PE300真菌ITSITSIF5-CTTGGTCATTTAGAGGAAGTAA-3300bp左右[9]ITS1区真菌ITSITS2R5-GCTGCGTTCTTCATCGATGC-3300bp左右[9]ITS1区PE250/PE300.真菌ITS1737F5-GGAAGTAAAAGTCGTAACAAGG-3300bp[10]真菌ITS2043R5-GCTGCGTTCTTCATCGATGC-3左右[10]PE250/PE300真菌ITSITS3F5-GCATCGATGAAGAACGCAGC-3200~500[11]ITS2区真菌ITSITS4R5-TCCTCCGCTTATTGATATGC-3bp[11]ITS2区PE300真菌ITSgITS75-GTGARTCATCGARTCTTTG-3250-500bp[12]ITS2区真菌ITSITS45-TCCTCCGCTTATTGATATGC-3250-500bp[12]ITS2区PE300真菌18SSSUO817F5-TTAGCATGGAATAATRRAATAGGA-3379bp[13]V5-V7区真菌18S1196R5\'-TCTGGACCTGGTGAGTTTCC-3379bp[13]V5-V7区PE250/PE300真核生物18SEuk1391f5-GTACACACCGCCCGTC-3200~300bp[14]V9区主要应用于水体环境真核生物18SEukBr5-TGATCCTTCTGCAGGTTCACCTAC-3200~300bp[14]V9区PE250/PE300真核生物18S454F5-CCAGCASCYGCGGTAATTCC-3~420bp[15]V4区真核生物18SV4r5-ACTTTCGTTCTTGATYRA-3~420bp[15]V4区PE250/PE300真核生物18SV41f5\'-CCAGCASCYGCGGTAATWCC-3~400bp[16]V4区真核生物18STAReukREV3R5-ACTTTCGTTCTTGATYRA-3~400bp[16]V4区PE250/PE300真核生物18STAReuk454FWD1F5-CCAGCASCYGCGGTAATTCC-3405bp[17]真核生物18STAReukREV3R5-ACTTTCGTTCTTGATYRA-3405bp[17]PE250/PE300真核藻类18S3NDF5-GGCAAGTCTGGTGCCAG-3450bp[18]真核藻类18SV4-euk-R2R5-ACGGTATCTRATCRTCTTCG-3450bp[18]PE300线虫18S引物NFIF5-GGTGGTGCATGGCCGTTCTTAGTT-3~400bp[19]线虫18S引物18Sr2bR5-TACAAAGGGCAGGGACGTAAT-3~400bp[19]PE250/PE300原虫18S引物RP841F5-GACTAGGGATTGGAGTGG-3511bp[20]原虫18S引物Reg1302R5-AATTGCAAAGATCTATCCC-3511bp[20]PE300细菌古菌通用引物515FmodF5-GTGYCAGCMGCCGCGGTAA-3291bp[21-22]V4区，细菌古菌兼顾细菌古菌通用引物806RmodR5-GGACTACNVGGGTWTCTAAT-3[21-22]V4区，细菌古菌兼顾PE250/PE300细菌古菌通用引物515F5-GTGCCAGCMGCCGCGG-3291bp[23]V4区，偏细菌细菌古菌通用引物806R5\'-GGACTACHVGGGTWTCTAAT-3291bp[23]V4区，偏细菌PE250/PE300古菌（单端序列分析）Arch344F5-ACGGGGYGCAGCAGGCGCGA-3571bp[24]V3-V5区，易产生嗜盐菌污染古菌（单端序列分析）Arch915R5-GTGCTCCCCCGCCAATTCCT-3571bp[24]V3-V5区，易产生嗜盐菌污染PE300古菌524F10extF5-TGYCAGCCGCCGCGGTAA-3434bp[25]V4-V5区古菌Arch958RmodR5-YCCGGCGTTGAVTCCAATT-3434bp[25]V4-V5区PE250/PE300古菌Arch519F5-CAGCCGCCGCGGTAA-3~400bp[26]V4-V5区古菌Arch915R5-GTGCTCCCCCGCCAATTCCT-3~400bp[26]V4-V5区PE250/PE300古菌V3V4区349F5-GYGCASCAGKCGMGAAW-3≈470bp[27]古菌V3V4区806R5-GGACTACVSGGGTATCTAAT-3≈470bp[27]PE300古菌细菌通用引物ArBa515F5-GTGCCAGCMGCCGCGGTAA-3291bp[26]V4区，偏古菌古菌细菌通用引物Arch806R5-GGACTACVSGGGTATCTAAT-3291bp[26]V4区，偏古菌PE250/PE300线粒体12SMiFish-U-F5-GTCGGTAAAACTCGTGCCAGC-3~180bp[27]-线粒体12SMiFish-U-R5-CATAGTGGGGTATCTAATCCCAGTTTG-3~180bp[27]-PE250/PE300植物内生细菌799F5-AACMGGATTAGATACCCKG-3二轮394bp[28-30]第二轮扩增V5-V7区植物内生细菌1392R5-ACGGGCGGTGTGTRC-3二轮394bp[28-30]第二轮扩增V5-V7区植物内生细菌799F5-AACMGGATTAGATACCCKG-3二轮394bp[28-30]第二轮扩增V5-V7区PE250/PE300植物内生细菌1193R5-ACGTCATCCCCACCTTCC-3二轮394bp[28-30]第二轮扩增V5-V7区PE250/PE300藻类23SA23SrVF1FGGACARAAAGACCCTATG~410bp[31]1藻类23SA23SrVR1RAGATCAGCCTGTTATCC~410bp[31]1藻类23SA23SrVF2FCARAAAGACCCTATGMAGCT~410bp[31]1PE250/PE300藻类23SA23SrVR2RTCAGCCTGTTATCCCTAG~410bp[31]1PE250/PE300注：ITS2R与2043R引物序列完全一致；18S真核V4r与TAReukREV3R引物序列完全一致表二：下表引物测序数据量为平均3万条cleanreads，单样本数据量最低不低于平均数据量的80%。测序类型引物名称引物序列长度参考文献备注适用平台反硝化细菌nirScd3aF5-GTSAACGTSAAGGARACSGG-3~400bp[34]—反硝化细菌nirSR3cdR5-GASTTCGGRTGSGTCTTGA-3~400bp[34]—PE250/PE300反硝化细菌nirS4F5-TTCRTCAAGACSCAYCCGAA-3300多bp[35]—反硝化细菌nirS6R5-CGTTGAACTTRCCGGT-3300多bp[35]—PE250/PE300固氮菌nifHnifHF5-AAAGGYGGWATCGGYAARTCCACCAC-3450bp[36]—固氮菌nifHnifHR5-TTGTTSGCSGCRTACATSGCCATCAT-3450bp[36]—PE250/PE300固氮菌nifHForF5-ACCCGCCTGATCCTGCACGCCAAGG-3~300bp[37]—固氮菌nifHRevR5-ACGATGTAGATTTCCTGGGCCTTGTT-3~300bp[37]—PE250/PE300固氮菌nifHPolyF5-TGCGAYCCSAARGCBGACTC-3~302bp[38]—固氮菌nifHPolyR5-ATSGCCATCATYTCRCCGGA-3~302bp[38]—PE250/PE300亚硝酸盐还原基因nirKlaCuF5-ATCATGGTSCTGCCGCG-3450bp[39]—亚硝酸盐还原基因nirKR3CuR5-GCCTCGATCAGRTTGTGGTT-3450bp[39]—PE250/PE300亚硝酸盐还原基因nirk-F5-TCATGGTGCTGCCGCGYGANGG-3~326bp[40]—亚硝酸盐还原基因nirk-R5\'-GAACTTGCCGGTKGCCCAGAC-3~326bp[40]—PE250/PE300氧化亚氮还原酶nosZ基因nosZ-1126F5-GGGCTBGGGCCRTTGCA-3~256bp[41]一氧化亚氮还原酶nosZ基因nos2-1381R5-GAAGCGRTCCTTSGARAACTTG-3~256bp[41]一PE250/PE300碱性磷酸酶phoD基因ALPS-F7305-CAGTGGGACGACCACGAGGT-3~300bp[42]--碱性磷酸酶phoD基因ALPS-11015-GAGGCCGATCGGCATGTCG-3~300bp[42]--PE250/PE300氨氧化细菌bamoA1F5-GGGGTTTCTACTGGTGGT-3490bp左右[43]一氨氧化细菌bamoA2R5-CCCCTCKGSAAAGCCTTCTTC-3490bp左右[43]一PE300氨氧化细菌amxAmx368F5-TTCGCAATGCCCGAAAGG-3463bp[44]氨氧化细菌amxAmx820R5-AAAACCCCTCTACTTAGTGCCC-3463bp[44]PE300氨氧化古菌Arch-amoA26F5-GACTACATMTTCTAYACWGAYTGGGC-3~415bp[45]—氨氧化古菌Arch-amoA417R5-GGKGTCATRTATGGWGGYAAYGTTGG-3~415bp[45]—PE250/PE300氨氧化古菌（单端序列分析）amoAF5-STAATGGTCTGGCTTAGACG-3600bp左右[46]—氨氧化古菌（单端序列分析）amoAR5-GCGGCCATCCATCTGTATGT-3600bp左右[46]—PE300产甲烷菌mcrAMLfF5\'-GGTGGTGTMGGATTCACACARTAYGCWACAGC-3470bp[47]一产甲烷菌mcrAMLrR5-TTCATTGCRTAGTTWGGRTAGTT-3470bp[47]一PE300甲烷氧化菌pmoAA189F5-GGNGACTGGGACTTCTGG-3508bp[48]—甲烷氧化菌pmoAmb661R5-CCGGMGCAACGTCYTTACC-3508bp[48]—PE300丛枝真菌AMLIF5\'-ATCAACTTTCGATGGTAGGATAGA-3二轮300bp[49]—丛枝真菌AML2R5-GAACCCAAACACTTTGGTTTCC-3二轮300bp[49]—丛枝真菌AMV4-5NF5-AAGCTCGTAGTTGAATTTCG-3二轮300bp[49]—丛枝真菌AMDGR5-CCCAACTATCCCTATTAATCAT-3二轮300bp[49]—PE250/PE300As甲基化基因arsMarsMF5‘-TCYCTCGGCTGCGGCAAYCCVAC-3347bp[50]As甲基化基因arsMarsMR15‘-CGWCCGCCWGGCTTWAGYACCCG-3347bp[50]PE250/PE300As还原基因arsCarsCF5‘-TCGCGTAATACGCTGGAGAT-3353bp[50]As还原基因arsCarsCR5‘-ACTTTCTCGCCGTCTTCCTT-3353bp[50]PE250/PE300固碳基因cbbLK2f5-ACCAYCAAGCCSAAGCTSGG-3495bp左右[51]固碳基因cbbLV2r5\'-GCCTTCSAGCTTGCCSACCRC-3495bp左右[51]PE300固碳基因cbbmcbbM-F15-TTCTGGCTGGGBGGHGAYTTYATYAARAAYGACGA3328bp[52]固碳基因cbbmcbbM-R5-CCGTGRCCRGCVCGRTGGTARTG-3328bp[52]PE250/PE300参考文献1.（27F/338R）RavelJ,GajerP,AbdoZ,etal.Vaginalmicrobiomeofreproductive-agewomenJ.ProceedingsoftheNationalAcademyofSciences,2011,108:4680-4687.2.27F/533R）ChenW,LiuF，LingZetal.Humanintestinallumenandmucosa-associatedmicrobiotainpatientswithcolorectalcancer[J.PloSone,2012,76):e39743.3.（515F/907R）YusoffMZM,HuA，FengC,etal.Influenceofpretreatedactivatedsludgeforelectricitygenerationinmicrobialfuelcellapplication[J.Bioresourcetechnology,2013,145:90-96.4.（338F/806R）XuN,TanGWangH,etal.Effectofbiocharadditionstosoilonnitrogenleaching，microbialbiomassandbacterialcommunitystructure[].EuropeanJournalofSoilBiology,2016,74:1-8.5.（341F/806R）Behrendt,L,Larkum，A，Trampe,Eetal.MicrobialdiversityofbiofilmcommunitiesinmicronichesassociatedwiththedidemnidascidianLissoclinumpatella.ISMEJ6,1222-12372012).6.（515F/926RWaltersWHydeER,Berg-LyonsD,AckermannG，HumphreyG,ParadaA，GilbertJA，JanssonJKCaporasoJG,FuhrmanJA，ApprillAKnightR.ImprovedBacterial16SrRNAGene（V4andV4-5)andFungalInternalTranscribedSpacerMarkerGenePrimersforMicrobialCommunitySurveys.mSystems.2015Dec22;1（1）:e00009-15.doi:10.1128/mSystems.00009-15.PMID:27822518;PMCID:PMC5069754.7.341F/785RHerlemann,D,Labrenz,M,Jurgens,Ketal.Transitionsinbacterialcommunitiesalongthe2000kmsalinitygradientoftheBalticSea.ISMEJ5,1571-15792011）8.（Ba9F/Ba515RmodRHenderson,G..Cox.F..Ganesh,S.etal.Rumenmicrobialcommunitycompositionvarieswithdietandhost,butacoremicrobiomeisfoundacrossawidegeographicalrange.SciRep5,145672015).9.(ITSIF/ITS2R）AdamsRI,MilettoM,TaylorJW,etal.Dispersalinmicrobes:fungiinindoorairaredominatedbyoutdoorairandshowdispersallimitationatshortdistances[].TheISMEjournal,2013,77)：1262-1273.#idc 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error#38.（nirk-F/nirk-R）YanT,FieldsMW，WuL,etal.Moleculardiversityandcharacterizationofnitritereductasegenefragments（nirKandnirSfromnitrate-anduranium-contaminatedgroundwater[].EnvironmentalMicrobiology,2003,5.39.（nosZ-1126F/nosZ-1381R）ChenZhe,LiuJinbo,WuMinna，XieXiaoli，WuJinshui，WeiWenxue（2012）DifferentiatedResponseofDenitrifyingCommunitiestoFertilizationRegimeinPaddySoil.MicrobialEcology63:446-59.40.（ALPS-F730/ALPS-1101）SakuraiM，WasakiJ，TomizawaY,etal.Analysisofbacterialcommunitiesonalkalinephosphatasegenesinsoilsuppliedwithorganicmatter[].SoilScience&PlantNutrition,2007.41.(bamoA1ForbamoA2R；amoAForamoARMaoY,YannarellAC,MackieRIChangesinN-transformingarchaeaandbacteriainsoilduringtheestablishmentofbioenergycrops[.PLoSOne,2011,6(9)：e24750.42.（Arch-amoA26F/Arch-amoA417R）ParkSJ,ParkBJ，RheeSK.Comparativeanalysisofarchaeal16SrRNAandamoAgenestoestimatetheabundanceanddiversityofammonia-oxidizingarchaeainmarinesediments.Extremophiles2008,124）:605-615.DOI:10.1007/s00792-008-0165-743.MLfForMLrR）ZhuC,ZhangJ,TangY,etal.Diversityofmethanogenicarchaeainabiogasreactorfedwithswinefecesasthemono-substratebymcrAanalysis[.Microbiologicalresearch,2011,166（1):27-35.44.（pmoA）DengY,LiuY,DumontM,etal.SalinityAffectstheCompositionoftheAerobicMethanotrophCommunityinAlkalineLakeSedimentsfromtheTibetanPlateauJ].MicrobialEcology,2016,73（1):1-10.45.（丛枝真菌）VanGeelM,BusschaertPHonnayO,etal.EvaluationofsixprimerpairstargetingthenuclearrRNAoperonforcharacterizationofarbuscularmycorrhizalfungal(AMF）communitiesusing454pyrosequencing[.Jouralofmicrobiologicalmethods,2014,106:93-100.附件四交互式生物信息云分析分析模块分析大类分析内容备注数据信息管理样本信息管理样本信息管理数据信息管理Metadata信息管理环境因子数据管理数据信息管理Metadata信息管理分组管理数据信息管理测序信息统计测序数据统计数据信息管理测序信息统计样本数据统计数据信息管理测序信息统计序列长度分布物种注释与评估0TU分析分类学分析物种注释与评估0TU分析Rank-Abundance曲线物种注释与评估0TU分析Pan/Core物种分析物种注释与评估Alpha多样性分析多样性指数物种注释与评估Alpha多样性分析指数组间差异检验物种注释与评估稀释曲线稀释曲线物种组成分析物种Venn图分析Venn图分析2≤样本（组）≤6物种组成分析群落组成分析群落柱形图物种组成分析群落组成分析群落饼图物种组成分析群落组成分析多级物种Sunburst图物种组成分析群落组成分析群落Heatmap图物种组成分析样本与物种关系Circos样本与物种关系图物种组成分析Ternary三元相图Ternary三元相图样本（组）=3样本比较分析Beta多样性分析样本层级聚类分析样本W3.样本比较分析Beta多样性分析样本距离Heatmap图样本≥3样本比较分析Beta多样性分析（3D-）PCA主成分分析样本W3样本比较分析Beta多样性分析多维PCA分析样本W18样本比较分析Beta多样性分析（3D-）PCoA主坐标分析样本W3样本比较分析Beta多样性分析NMDS非度量多维尺度分析样本W3样本比较分析样本分组分析ANOSIM相似性分析分组W2，每组样本W3样本比较分析样本分组分析Adonis置换多元方差分析分组W2，每组样本W3样本比较分析样本分组分析PERMANOVA分析分组W2，每组样本W3；或提供环境因子样本比较分析样本分组分析PLS-DA偏最小二乘法判别分析分组W2，每组样本W3物种差异分析组间差异显著性检验多组样本物种差异分析One-wayANOVA，分组W3，每组样本W3物种差异分析组间差异显著性检验多组样本物种差异分析Kruskal-Wallis秩和检验，同上物种差异分析组间差异显著性检验两组样本物种差异分析WelchT检验，分组=2，每组样本W3物种差异分析组间差异显著性检验两组样本物种差异分析StudentT检验，分组=2，每组样本W3物种差异分析组间差异显著性检验两组样本物种差异分析Wilcoxon秩和检验，分组=2，每组样本W5物种差异分析组间差异显著性检验两组样本物种差异分析Wilcoxon符号秩检验，分组=2，每组样本W5物种差异分析组间差异显著性检验两样本物种差异分析样本=2物种差异分析LEfSe分析LEfSe分析分组W2，每组样本W3物种差异分析MetagenomeSeq分析MetagenomeSeq分析分组=2，每组样本W4环境因子关联分析VIF方差膨胀因子分析VIF方差膨胀因子分析样本W4环境因子关联分析RDA/CCA分析RDA/CCA分析样本W3，环境因子数迎..dbRDA分析dbRDA分析样本W3，环境因子数相关性Heatmap图相关性Heatmap图样本W3，环境因子数W2（Partial）Manteltest分析（Partial）Manteltest分析数值型矩阵=2排序回归分析排序回归分析样本W3，建议样本W10VPA方差分解分析VPA分析2≤环境因子分组≤4Procrustes分析Procrustes分析关联与模型预测Network网络分析共现性网络分析关联与模型预测Network网络分析单因素相关性网络分析样本W3关联与模型预测Network网络分析双因素相关性网络分析样本W3进化分析系统发生进化树系统发生进化树进化分析系统发生进化树个性化系统发生进化树提供外源参考物种序列fasta文件进化分析系统发生进化树环形进化树图功能预测PICRUStl功能预测KEGG功能预测细菌、古菌16S功能预测PICRUStl功能预测COG功能预测细菌、古菌16S功能预测PICRUSt2功能预测KEGG功能预测细菌、古菌16S；真菌ITS、18S功能预测PICRUSt2功能预测MetaCycpathway功能预测细菌、古菌16S；真菌ITS、18S功能预测PICRUSt2功能预测COG功能预测细菌、古菌16S功能预测Tax4Fun功能预测KEGG功能预测细菌、古菌16S功能预测FUNGuild功能预测FUNGuild功能预测真菌ITS、18SMicroPITA分析MicroPITA分析MicroPITA分析说明：结果图表默认为美吉生物云（http://www.majorbio.com/）交互分析所提供的格式，甲方可在线查看、下载、打印结果报告。江西省政府采购服务工程合同合同编号：2024M0902369900000020，2024M0902369900000020采购单位（甲方）：江西省水产科学研究所供货商（乙方）：上海美吉生物医药科技有限公司为了保护甲乙双方合法权益，根据《中华人民共和国民法典》及相关法律法规以及江西省财政厅江西省国家机关、事业单位、团体组织【服务类专区】-在线征集的项目-上海美吉生物医药科技有限公司江西省本级服务工程项目招标文件、中标供应商的投标文件、服务工程项目协议和承诺书，双方签署本合同，以资共同遵守。一、采购标的金额单位：元序号商品名称品牌型号配置要求采购数量单位成交单价1微生物多样性测序--检测周期:30个工作日,品牌:1件13000.00合同总价（元）合同总价（元）13000.0013000.0013000.0013000.0013000.0013000.00合同总价（大写）合同总价（大写）壹万叁仟元整壹万叁仟元整壹万叁仟元整壹万叁仟元整壹万叁仟元整壹万叁仟元整注：合同总价包含商品到达甲方并能正常使用所需的一切费用，包括但不限于商品购置费、包装费、运输费、装卸费、保险费、安装调试费、技术服务费、培训费以及保修费、税费等。二、货款结算1、甲方应于货物验收合格后个工作日内将货款全部支付给乙方。2、甲方付款前，乙方应向甲方开具等额有效的增值税发票，甲方未收到发票的，有权不予支付相应款项直至乙方提供合格发票，并不承担延迟付款责任。发票认证通过是付款的必要前提之一。3、三、履约保证金（如有）1、本合同签订后个工作日内，乙方应向甲方支付合同总价%的履约保证金，作为乙方认真履行合同条款的保证。2、乙方没有履行本合同项下约定的责任和义务所需承担的违约金、赔偿金及其他费用，甲方有权直接从履约保证金中扣除，履约保证金中不足以扣除的，甲方有权从任何一笔货款中扣除。剩余履约保证金（如有）自合同约定的质保期届满后由甲方无息返还给乙方。3、四、货物包装与交付1、货物的包装应适于长途运输和反复装卸，并且乙方应根据货物不同的特性和要求采取防潮、防雨、防锈、防震、防腐等保护措施，以保证货物安全无损地到达甲方指定地点。乙方将承担因包装不当导致交付的合同标的物受损的责任。2、乙方在交付产品的同时需向甲方提供有关货物的附随资料，包括但不限于：商品目录、安装图纸、使用说明书、质量证明及其他技术资料（如有）。3、交货期：4、交货方式：1/35、收货人：徐先栋;联系方式：152709276106、收货地址：江西省南昌市南昌高新技术产业开发区富大有路1099号江西省水产科学研究所7、五、安装与验收1、安装调试（如有）：乙方负责在甲方指定的时间内，按照甲方的要求完成货物的安装调试。乙方应严格遵守安全法律法规，采取安全保障措施，保证人员安全。因乙方原因造成的人员伤亡和财产损失，均由乙方承担。2、验收标准：详见服务工程项目协议书约定的验收标准或质量要求；3、到货验收：甲方应在收到货物后个工作日内进行到货验收。甲方仅对产品的数量和外观进行检验，并不因此减轻或免除乙方所应承担的质量保证责任。4、最终验收（如有）：安装调测完毕后，乙方应配合甲方进行最终验收，验收结果以甲方签署的验收证明为准。5、六、保修与售后服务1、货物质保期为，自到货验收合格或最终验收合格之日起至质保期届满且经甲方确认无任何质量问题时止。2、乙方承诺所售商品，自甲方收到商品之日起日内可以无理由退货，日内可以换货。更换后的货物质保期应重新计算。3、质保期内，乙方应当提供7×24小时电话支持服务。乙方接到甲方保修通知后个小时内响应，个小时内排除故障。对于质保期内不能修复的产品/部件，乙方应在个小时内免费更换备品备件。4、质保期届满后，乙方对本合同项下货物提供终身维修服务，且维修时只收取所需维修部件的成本费，服务内容应与质保期内的要求相一致。5、七、知识产权及其他民事权利的保护1、乙方保证向甲方交付的货物、软件、技术资料等，不会侵犯任何第三人的专利权、著作权、商标权、商业秘密、其他知识产权或者其他民事权利。如乙方违反上述规定，则乙方应负责消除甲方拥有并使用乙方交付的货物、软件、技术资料等所存在的全部法律障碍，并赔偿甲方的损失。2、八、违约责任1、甲方逾期支付（申请支付）货款的，自逾期之日起，向乙方每日偿付合同总价‰的违约金；甲方无正当理由拒付货款的，应向乙方偿付合同总价%的违约金。2、乙方逾期供货的，自逾期之日起，向甲方每日偿付合同总价‰的违约金；乙方逾期日不能交货的，应向甲方支付合同总价%的违约金，并且甲方有权解除本合同，不再退还履约保证金（如有）。乙方未在约定时间内完成安装调试（如有）的，参照前款约定承担违约责任。3、乙方违反本合同和招投标文件约定的有关质量保证及售后服务等的，每发生一次，乙方应向甲方支付元违约金。同时，甲方有权委托第三方进行保修，所产生的费用由乙方承担。若因货物缺陷或乙方服务质量等问题造成甲方或任何人员人身、财产损害的，乙方应承担有关责任并作出相应赔偿。4、乙方没有按网上超市协议承诺的价格或优惠率签订合同并供货的，甲方有权没收履约保证金（如有），同时，报经政府采购监管部门批准按照相关政府采购法律法规的规定对其进行处罚。5、九、法律适用与争议解决1、本合同的订立、解释、履行及争议解决，均适用中华人民共和国法律。2/32、本合同履行过程中发生争议的，甲乙双方应友好协商；协商不成的，任何一方可向甲方所在地人民法院起诉。3、十、合同生效及其他1、江西省财政厅江西省国家机关、事业单位、团体组织【服务类专区】-在线征集的项目-上海美吉生物医药科技有限公司江西省本级网上超市项目招标文件以及投标文件、询标纪要、服务工程项目入围协议和承诺书是本合同不可分割的组成部分，本合同未尽事宜从其规定。若本合同约定与前述文件约定不一致的，按照下列顺序予以解释：（1）本合同履行过程中双方签署的变更或补充协议（如有）；（2）本合同；（3）服务工程项目入围协议和承诺书；（4）投标文件；（5）其他合同文件。2、本合同经甲乙双方加盖公章后生效。合同内容如遇国家法律、法规及政策另有规定的，从其规定。3、本合同一式两份，甲乙双方各执一份，具有同等法律效力。4、（本页无正文，为《服务工程合同》之签章页）甲方（公章）：，乙方（公章）：法定（授权）代表人，法定（授权）代表人（签字）：，（签字）：地址：，地址：电话：，电话：开户银行：，开户银行：浦东发展银行张江科技支行账号：，账号：97160154740003720签订日期：年月日，签订日期：年月日3/3 附件下载 环境微生物群落多样性测序及交互式分析项目合作协议书.pdf下载关于宏基因组测序的服务工程合同(2024M0902369900000020).pdf下载